黒糖は県内離島の含みつ糖工場で作られている。比較的生産量の多い宮古（多良間）、波照間、西表の３製糖は株式会社。残る伊平屋、伊江、粟国、小浜、与那国の５製糖はＪＡおきなわが運営している。